Beschreibung:
T4 DNA Ligase katalysiert die Formation der Phosphodiesterbindungen zwischen den 5'-Phosphat- und 3'-Hydroxylenden in der duplex DNA/RNA. Das Enzym verbindet die
'blunt'-Enden und die kohäsiven Enden, repariert Einzelstrangbrüche in der duplex DNA, RNA, oder DNA/RNA-Hybriden. Diese T4 DNA Ligase wurde aus einem E. coli Klon gewonnen, der ein
Plasmid enthält, das die Synthese der T4 DNA Ligase steuert.
Konzentration: 2,5 WU/µl ( 500 CE Units/µl)
Anwendung:
Klonierung von Restriktionsverdau-Fragmenten, verbinden der Linker und Adapter zu 'blunt-ended' DNA, Gen- (Genfragment) Synthese.
Kohäsive Enden-Ligation:
Für die meisten kohäsiven Endligationen ist eine Inkubationszeit von 30 Minuten bei 20°C ausreichend. Inkubationen bei 16°C für 4 - 16 Stunden werden routinemäßig
für die Mehrheit der Anwendungen durchgeführt.
Ligationen von 'blunt end' und Einzelbasenpaar-Überhangfragmenten benötigten mehr Enzym, um dasselbe Maß an Ligation zu erhalten, wie bei kohäsiven
End-DNA-Fragmenten. Die Ligation kann möglicherweise durch die Zugabe von PEG oder durch die Reduzierung der rATP-Konzentration gesteigert werden. ATP ist ein essentieller Kofaktor für die
Reaktion.
Lagerpuffer: 50 mM KCl, 10 mM Tris · HCl (pH 7,4), 0,1 mM EDTA, 1 mM DTT, 200µg/ml BSA, 50 % Glycerin.
Reaktionspuffer (10x) enthält 500 mM Tris · HCl (pH 7,8), 100 mM MgCl2, 100 mM DTT und 10 mM ATP
"FAST LIGATION"-Reaktionspuffer (2X) mit:60 mM Tris-HCl (pH 7.8 at 25 °C), 20 mM MgCl2, 20 mM DTT, 2 mM ATP
und 10 % PEG
Einheitendefinition:
Eine Einheit ist definiert als die Menge Enzym, die benötigt wird, um eine 50%ige Ligation eines Hind III-Fragmentes einer Lambda DNA in 30 Minuten bei 16°C
bei einer Konzentration von 5'-Enden von 0,12 μM (300 μg/ml) zu erhalten. Eine Weiss-Einheit entspricht 200 kohäsiven End-Ligationseinheiten. Jede Charge einer T4 DNA Ligase wird auf die
Abwesenheit von Endonukleasen/Exonukleasen und in einem blau/weiß Klonierungsansatz getestet.
Haltbarkeit: ca. 24 Monate bei -20°C
Lagerung: bei - 20°C
Transport: mit Kühlakkus
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