Anwendungen:
- RT PCR
- Synthese von cDNA
- mRNA 5'-Ende-Mapping durch Primer-Extension-Analyse
- Endmarkierung von DNA
- Didesoxynukleotid-Sequenzierung
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Anwendungen:
- RT PCR
- Synthese von cDNA
- mRNA 5'-Ende-Mapping durch Primer-Extension-Analyse
- Endmarkierung von DNA
- Didesoxynukleotid-Sequenzierung
Nutzen:
- Die konstruierte M-MLV RT bleibt bis zu 50 °C aktiv und erhöht so
die Länge und Ausbeute der cDNA im Vergleich zur WT-Version.
- Kann cDNA in Reaktionen mit weniger als 100 pg RNA-Vorlage
effizient erkennen und produzieren.
- Amplifickation bis zu 8kb.
- reduzierte RNase H-Aktivität (RNase H–) als der Wildtyp M-MLV
RT.
Beschreibung:
M-MuLV Reverse Transkriptase, kodiert durch das Moloney Murine Leukemia Virus (M-MuLV RT), ist eine RNA-abhängige DNA-Polymerase,
die den ersten Strang der cDNA aus einer einzelsträngigen RNA-Vorlage synthetisiert, an die ein Primer hybridisiert wurde. M-MuLV RT verlängert auch Primer, die an einzelsträngige DNA
hybridisiert sind. Die Synthese des zweiten Strangs der cDNA kann aus einigen mRNA-Vorlagen ohne zusätzliche DNA-Polymerase erreicht werden.
Konzentration: 200 u/µl
Speicherpuffer:
20 mM Tris-HCl pH 7,4, 100 mM NaCl, 0,1 mM EDTA, 50 % Glycerin, 0,1 % IGEPAL, 1 mM DTT.
Reaktionspuffer komplett 10X: 50,0 mM
Tris-HCl (pH 8,3 bei 25 °C); 3,0 mM MgCl 2 ;
75,0 mM KCl;
10,0 mM DTT .
Verdünnungspuffer 1X :
10 mM KH 2 PO 4 (pH 7,5); 0,1 mM EDTA; 200 mM NaCl; 7 mM 2-Mercaptoethanol; 50 % Glycerin
Einheitendefinition:
Eine Einheit des Enzyms baut 1 nmol dTTP in 10 Minuten bei 37 °C in säurefällbares Material ein, wobei
Poly(A)-Oligo-dT als Matrizenprimer verwendet wird.
Transport: auf blauem Eis
Lagerung: bei -20°C für 24 Monate
Notes: RT Enzym / MMLV RTase / RNA Template / Complementary DNA / cDNA / Reverse Transkription / Molecular cloning / RNA Sequenzierung / PCR / Genomanalyse / superscript
Anwendung:
Standardprotokoll: Wir empfehlen die Herstellung von 2 Mischungen
Mischung I
Komponente |
Menge/Konz. |
a. Gesamt-RNA |
1–5 µg |
steriles Wasser |
bis zu 8 µl |
Inkubation |
Temperatur |
10 Minuten |
70 °C |
10 - 15 min (für c.- spezifische Primer) |
Zimmertemperatur, |
Mischung II
Komponente |
Menge/Konz. |
10X Reaktionspuffer |
2 µl |
dNTP-Mischung (je 10 mM = 40 mM) |
1 µl |
optional: RNAsin |
20-40 Einheiten |
MMLV Reverase (200 U/µl) |
200 Einheiten |
steriles Wasser |
bis zu 20 µl |
Mix I und Mix II mischen und vorsichtig vormixen |
|
Schritt |
Temperatur |
30 - 115 min 1.) |
37 - 55°C 2.) |
10 min (Inaktivierung des Enzyms) |
65-70°C |
1.) 30
min für cDNA mit 500 bp; 115 min für 1,5 kb
2.) hängt von der RNA ab: Höhere Temperaturen (bis 55 °C) für höher strukturierte RNA; Versuchen Sie, den pH-Wert auf 8,8 einzustellen
Hinweis: MMLV eignet sich unter Standardreaktionsbedingungen bei 37 °C am besten für die Synthese von 8 kb oder weniger.
Eine Erhöhung der Reaktionstemperatur auf 42 °C kann eine Synthese von bis zu 10 kb ermöglichen. Die MMLV-Aktivität sinkt über 42 °C drastisch.
Quality control:
Endonuclease Activity: 1 µg of Type 1 supercoiled plasmid DNA is incubated with 500 units of enzyme in 1X reaction buffer for one hour at 37°C. The supercoiled DNA is visualized on an
ethidium bromide-stained agarose gel to verify absence of nicking or cutting.
Nuclease Activity: 50 ng of radio labelled DNA or RNA is incubated with 200 units of enzyme in 1X reaction buffer for one hour at 37°C, resulting in <1% release for both DNase and
RNase.
Purity: >90% as judged by SDS-polyacrylamide gels with blue staining. MMLV RT is free of detectable RNase,
and DNase (exo- and endonuclease) activities.